在小五郎的带领下，柯南他们一行人来到了位于太平洋上的小岛”神海岛”度假
自古以来，关于”神海岛”流传着两个传说
一个是沉入海底的古代遗迹”海底宫殿”
另一个则是300年前真实存在的女海盗”安妮邦妮”"玛莉雷德”遗留下来的财宝
兰和园子在海底宫殿附近的海域享受有痒潜水时，却意外遭遇了觊视财宝而来的宝藏猎人
突然，1名宝藏猎人遭到鲨鱼群的袭击
兰和园子好不容易才从险境中逃脱出来
那名被袭击的宝藏猎人却死掉了
匆忙赶到的柯南，对于宝藏猎人的死亡发现了疑点
于是，和灰原一起开始了调查
宝藏猎人是因为海盗的财宝而被害的吗？
柯南他们一边寻找行迹可疑的宝藏猎人，一边追查成为案件动机的财宝传说、解开案发现场海底宫殿的谜团
随着调查的深入
谜一样的词语”Jolly Roger”浮出水面
柯南一步步接近传说中真相
找到的一部分财宝竟被谜一样的宝藏猎人抢走了
而且，宝藏猎人的魔手继而伸向兰和园子
他们的目的，到底是什么？
隐秘在传说中的讯息是什么？
隐藏在海底宫殿的秘密又是什么？
跨越了300年的暗号，柯南将逐一解开！
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呦，你也看柯南了？
我一直都看的啊~~呵呵